Фармакофорне моделювання селективної взаємодії лігандів з ізоформами цитохрому P450

Анотація

Цитохроми P450 (CYP) є ключовими ферментами, які залучені до метаболізму лікарських засобів і демонструють високу селективність щодо субстратів та інгібіторів. Така селективність пов’язана з особливостями просторової будови активного сайту різних ізоформ ферменту.
Мета дослідження – встановити причину селективної взаємодії субстратів та інгібіторів із різними ізоформами CYP шляхом виявлення структурних і функціональних особливостей активного сайту ферментів, які зумовлюють відмінності їхньої специфічності.
У цьому дослідженні застосовано методи фармакофорного моделювання для ідентифікації характерних взаємодій між лігандами й окремими ізоформами CYP. На основі аналізу просторових
та електронних характеристик субстратів й інгібіторів побудовано фармакофорні моделі для окремих ізоформ.
Результати дозволили встановити ключові детермінанти селективного зв’язування та можуть бути використані для прогнозування метаболізму, проєктування селективних інгібіторів, а також
оптимізації лікарських сполук на етапі доклінічного скринінгу.